این حوزه ها باکمک جامعهء پژوهشگران فعال درروش چندرشته ای درزمینه های زیست شناسی ,بیوشیمی ,شیمی,پزشکی,یادگیری ماشین,هستی شناسی رسمی, پردازش زبان طبیعی, بیوانفورماتیک ودیگرموارد,مورد تحقیق قرار می گیرند.هدف این همایش(سمینار),گردهم اوردن محققان ازتمام حوزه هابودتابرروی بیان هنری درهرزمینهء پژوهشی بررسی کنند, وهم چنین تناسب وپیشرفت منابع موجودرابحث کنند,وحوزه هایی راشناسایی کنندکه ماابزارها, استانداردها یامنابع رانداریم وایجادفرصت هایی برای تحقیق مربوط به هستی شناسی ومتن کاوی برای منافع پژوهش علوم زیستی.درآماده سازی این همایش وقبل ازجلسه,برگزارکنندگان سه حوزه راتعیین کردند که بهترین دستاوردها وچالش هارادرگردهم آوردنپژوهش های زیست شناختی ,متن کاوی وهستی شناسی برجسته می کند.
1- بررسی منافع حاصل ازروابط بهبودیافته بین متن کاوی وهستی شناسی مربوط به زیست شناختی.
2- پیشرفت های تخصصی درمتن کاوی وکاربرد آنها برایتحقیقات علوم زیستی.
3- داستان های موفقیت آمیزازراه حل های متن کاوی باوبدون کمک هستی شناسی.
این سمینار,بیش از40 پژوهشگرمشهوربین اللملی راازبین تمام حوزه های مذکردربالا گرد هم آورده است. فضای سمیناربامفاهیمی ازبحث های شادوهیجان انگیز وطولانی ,بهترتوصیف می شود.
بحث عمدتا" بابیان نیازها,اهداف وانتظارات بین کاوش کران وجامعه ی هستی شناسان درجریان بود. ازطرف دیگر,برخی گفتگوها,ادغام موفقیت آمیز راه حل های کاوش گری راباتحقیق درطرح مربوط به هستی شناسی وبهره برداری ازمنابع مربوط به هستی شناسی برای راه حل های موفق کاوشگران خاطرنشان می کند.
3 – هستی شناسی برای کاوشگری – کاوشگری برای هستی شناسی.
یک سوال تحقیقاتی بسیارمهم دراینحوزه این است که چگونه منابع اصلاح شناختی ازقبیل هستی شناسی,می تواندبازیابی اطلاعات (مخفف آن IR )وراه حل های استخراج اطلاعات (IE ) وبالعکس راحمایت وپشتیبانی کنند. دراین نظریه ,می توان انتظار داشت که منبع بزرگ اصلاح شناختی ,به خوبی دانش این حوزه راپوشش می دهند وبطور موثربه یک گام اساسی استخراج اطلاعات عرضه می شوند. یعنی به بازشناسی موجودیت مشهور( NER ) درهردوموردIR (بازیابی اطلاعات) IE ( استخراج اطلاعات).
درواقع,منابع مفهومی مثل هستی شناسی ازمنابع اصلاح شناختی ضعیفی تشکیل می شوند به خاطر اینکه آنها هرگز برای خدمت به این هدف طراحی نشده اند. ازچشم انداز متن کاوی,آنها پوشش کمی به بخش مهم دانش حوزه دارندیعنی آنها هنوزکم جمعیت هستند وشامل تنوع نحوی وریخت شناسی نمی شوند.(ازاین گذشته ,هدف ازمنبع مربوط به هستی شناسی نیست).
ازطرف دیگر,محققان زیستی ,تلاش قابل توجهی به توسعه هرچه بیشتر وکامل ترمنابع مربوط به هستی شناسی دارند. این موضوع مرکزبحث های مفیدوپی درپی درطول کل جلسه بود. باانتخاب چندمثال ,سخنرانی های زیردرسمیناربرروی پژوهش درحال انجام به نمایش گذاشته می شودکه ازکاوشگری به هستی شناسی شامل می شود.
پل برتلر,بر روی چرخه عمرهستی شناسی تمرکز می کند وتاکیدبروفق دادن دائم هستی شناسی به نیازهای درحال تغییرازجامعه دارد.
این موضوع هم چنین توسط جانگ.سی.پالک(ازکره) مورد حمایت قرار گرفت,که تمایل هایش رادرمورد دنبال کردن تغییرات درهستی شناسی ژنی,به اثبات رسانید.
رابرت استفانی (دانشگاه منچستر,بریتانیای کبیر(انگلستان))وکریستوفربروستر(دانشگاه شفیلد, انگلستان) ودیویدشاتن(دانشگاه آکسفورد,انگلستان),درباره پروژه دردست اقدام هستی شناسی برای رفتار طبیعی بااستفاده ازکاوشگری گزارش کرده اند؛نتایج اولیه ازپروژه های مشابه برای داده فنوتایپ ومتابولیسم لیپیدها توسط الف لسر وتوماس واچتر, به ترتیب ارائه شده است.
هرسه سخنرانی ها ,این مشکل رابرجسته کردند که علیرغم,وجودمقالات زیادی درباره یادگیری هستی شناسی ,واقعا" روش های خیلی کم به آسانی دردسترس است. استفان شوتز, آخرین تحولات درهستی شناسی BIOTOP راتوضیح می دهد که قصددارد پلی باشدازسطح بالای هستی شناسی مثلBOF به هستی شناسی خاص حوزه ازقبیل هستی شناسی ژنی.
مطالعاتی دردست اقدام است به منظور استفاده ازBIOTOP برای ابهام زدایی معنی کلمه, که یک گام اساسی درکاوشگری به شمار می رود.
رابرت استفانزدرخلاصه اش ازآنروز,خاطرنشان کردکه خطرخاصی وجودداردکه هستی شناسان درهنگام استفاده ازنتایج کاوشگری برای توسعه هستی شناسی ,ناامید هستندواینکه محققان متن کاوی,به خاطر نقایص هستی شناسی موجودازقبیل ناتمامیت ومدل ناکافی ازتنوع لغوی دراصطلاح شناسی مورد استفاده شده برای بیان مفاهیم,ناامید هستند. به هرحال, این سمینار درنشان دادن خطوط مرزی وپل هوایی بین دوحوزه تحقیقاتی,موفق بوده که به شیوه های جدید الهام می دهد.